Основные направления деятельности ЯФИТ – научные исследования региональных проблем туберкулёза и внедрение научных достижений в противотуберкулёзную практику; организационнометодическая работа по расширению и укреплению сети противотуберкулёзных учреждений, оснащение их лечебно-диагностической аппаратурой, обучение и укомплектование штатов врачей-фтизиатров; санитарное просвещение населения, что было тогда очень важно. Под руководством Е. Н. Андреева Якутский филиал АМН СССР, с 1962 г. переименованный в Якутский научно-исследовательский институт туберкулёза Министерства здравоохранения РСФСР, в течение 1950-1964 гг. занимался изучением эпидемиологии и патологии туберкулёза в Якутской АССР, разработкой и внедрением эффективных методов своевременного выявления, полноценного лечения и профилактики туберкулёзных заболеваний. Было издано 11 сборников научных трудов, 2 пособия по туберкулёзу для врачей и фельдшеров, 1 монография (Е. Г. Мазина) и большое число брошюр санитарно-просветительного и научно-популярного содержания. Общее число статей, опубликованных в сборниках филиала (и института), а также в центральной печати, составило 334. Было защищено 15 кандидатских диссертаций, из которых 8 выполнено представителями коренных народов. Е. Н. Андреев в 1954 г. одним из первых якутян защитил кандидатскую диссертацию в Отделении клинической медицины АМН СССР ҺТуберкулёз и борьба с ним в Якутский АССРһ
